高通量单细胞单分子液滴分选与封装系统
可实现DNA或细胞封装和高吞吐量分选。 这使得能够以前所未有的速度筛选大型复杂的基因库。
该系统是一种多功能和用户友好型皮升级液滴发生器,触摸屏化操作,完全自动化液滴生成。用于准备DNA,细胞和其他生物材料样品,然后用于下游的高分辨率分析。 可以安全、快速地将单个分子、DNA片段、单个细胞或单个细胞器与生化反应试剂一起封装在高度稳定的双乳状或单乳状液滴中。这些液滴能在PCR、涡旋、孵育和长期储存过程中保持稳定。
采用先进的专有微流体技术,跨越基因和细胞研究的下一个前沿。它的独特设计能帮助研究人员对人类、
动物、植物和微生物的细胞和基因组获得分辨率的信息。
可以在用户友好型的工作流程中生成和分类双乳液滴,不需要任何使用过荧光细胞分类器的经验。
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工作流程从将100 kb的DNA片段、小单细胞或其他生物材料捕捉在高度稳定的液滴中开始,以用于诸如PCR和酶活性评价等测试当中。
然后,根据内含物的荧光对液滴进行分类,分离得到只含有感兴趣内容物的液滴,用于下游高分辨率分析,如:
●验证CRISPR基因编辑没有隐藏意外重组的PCR偏差。
●识别重排,如融合和倒置。
●填补基因组区域的空白。
●识别病毒和转基因整合位点。
●在单细胞水平评估酶活性。
●进行高通量GFP筛选。绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)是一种常用的报告基因
提供该系统所需的全系列试剂,用于包裹封装DNA、RNA、细胞器或小细胞。生成高度稳定的微纳双乳化液滴,
这些数以百万计的液滴分别封装分子,细胞器,或小细胞(高达6µm直径)。每一个液滴都相当于一个反应室在其内进行单个分子或单个细胞分辨率水平的分析。
液滴是什么样子
基于微流体,在一个简单的工作过程中将数百万个分子分成液滴,从而能够高质量地靶向富集大片段(3E100 kb),
用于后续测序 ,允许从几毫微克的脱氧核糖核酸开始靶向富集长脱氧核糖核酸分子。该系统是基于分离数百万个液滴中的长DNA片段,其中含有感兴趣目标序列的液滴被荧光标记,并使用流式细胞术进行分类。该系统程序的终产品是可以通过测序研究的长脱氧核糖核酸分子的富集群体。是研究复杂基因组区域的有效富集技术。
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为什么要选择该系统:
它提供了从大基因文库中准备基因材料的手段以用于高分辨率的筛查分析。
帮助回答一系列的基因组学和分子生物学问题。
支持合成生物学的工作流程,如酶进化及其路径工程。
具有用户友好型接口,具有将微液体技术接入各实验室的能力
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典型应用:
与适当的液滴分离、测序和分析技术相结合,该系统可应用于以下等几个方面:
●长或短读测序
●基因编辑分析
●无偏全基因组扩增
●酶活性评价
实现单分子或单细胞分辨率
确保您为单分子或单细胞分析捕获了正确的材料。该系统通过将生命的构建模块封装在微微升双乳液或单乳液液滴中,支持高分辨率的基因组学、宏基因组学和分子生物学工作流程。这种独特的方法使以前未知的基因组区域可用于长读和短读测序,提高了全基因组扩增的分辨率,支持单细胞酶活性的评估等等。
1、基因组学应用
提高基因组学和宏基因组学研究的分辨率。使用我们系统以及测序建议和生物信息学工具来执行一系列基因组学工作流程该系统在人类、其他动物、植物和微生物DNA的长读和短读测序工作流程中证明了其性能。
聚光灯:植物基因组学
克服对植物庞大而复杂的基因组进行测序的挑战。该系统在支持各种植物基因组学工作方面表现出色,包括:
- 特征不明显的基因簇分析
- 由于参考基因组和植物品种之间的低对应性导致的间隙闭合
- 植物基因组结构重排的解析
- 生物合成基因簇的检查
2、基于细胞的应用
使用该系统封装单个小细胞,包括微生物和藻类,以及生物活性分子。我们高度稳定的双乳化液滴提供了一种方法,可以孵育单个活细胞进行分析,并对它们进行分类,以在基于细胞的工作流程中获得高分辨率。Xdrop在封装细胞核方面也有良好的表现,其他细胞器的工作流程正在测试中。
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