尽管国家大力推进猪粪资源再利用，鼓励制造加工有机肥。但事实上并不是所有的猪场都能制造加工出符合标准的商品化有机肥料，更多的猪场发酵猪粪只能作为农家肥自用，基本实现无害化处理和资源化再利用。
猪粪做有机肥制造加工的基本原理就是把猪粪尿等有机物料与木糠、秸秆碎等混合，添加微生物发酵菌（农富康生物菌肥发酵剂）进行好氧发酵，将有机质转化为稳定腐殖质的过程。
水分是有机肥制造加工中一项重要指标。因此，干猪粪更适合制造加工有机肥。农富康专家指出，堆肥发酵的第一步就是调水分，好适合的水分是50%-60%,过干或过湿都会影响好氧发酵过程。
干猪粪的利用率能达到70%-80%,而水泡粪或水冲粪再固液分离出来的猪粪含水量高，利用率不到50%.而且养分溶于水，也降低了肥效，降低制造加工有机肥的价值。“高床发酵型生态养猪模式”直接将猪舍与有机肥制造加工车间相结合，粪尿一起处理，更加节约场地和人力物力。猪舍两层结构，二层养猪采用温控通风设备，全漏缝地板结构，养猪制造加工过程中不冲水、产生的猪粪尿通过漏缝板落入一层垫料中;猪舍一层高度为2.5-2.8m,铺设木糠等垫料消纳猪粪尿，垫料厚度60-70cm,翻堆机自动翻堆，初步发酵半腐熟有机肥，再转移到有机肥车间进一步发酵。
猪粪收集起来之后，进行有机肥发酵有一些门道。农富康专家表示，首先要通过添加高含碳、低含水份的辅料，把水份和C/N比调节到合适的比例。然后，根据猪场规模和场地选择发酵方式。完整的堆肥发酵包括升温期、高温期、降温腐熟期三个阶段。一般猪场简易情况下，主要进行高温期，通过好氧发酵杀灭虫卵等以达到无害化目的。好氧发酵需要不断翻堆，有条件的猪场可以使用通风设备，这个过程通常需要20天。
猪粪发酵有机肥具体发酵过程如下：
步骤一、发酵猪粪做有机肥物料配比。 1.5吨猪粪(新鲜粪便约2.5吨)加1袋农富康有机肥发酵剂(订货电话：150-3906-7649)，发酵剂需与米糠(或麸皮、玉米粉等替代物)按1：5的比例混匀后，再均匀撒入猪粪堆，混拌均匀。好好加入秸秆或蘑菇渣等调节一下碳氮比。
步骤二、发酵猪粪做有机肥物料建堆。在做堆时不能做的太小太矮，太小会影响发酵，高度在1.5米～2米，宽度2米，长度不限。
步骤三、发酵猪粪做有机肥温度要求。启动温度应在15℃以上较好(四季可作业，不受季节影响，冬天尽量在室内或大棚内发酵)
步骤四、发酵猪粪做有机肥水分要求。发酵物料的水分应控制在65%左右。过高过低均不利于发酵,水过少,发酵慢;水过多会导致通气差、升温慢，并产生臭味。调整物料水分方法：水分过高可添加秸秆、锯末屑、蘑菇渣、干泥土粉等。水分合适与否判断办法：手紧抓一把物料，指缝见水印但不滴水，落地即散为宜。
步骤五、发酵猪粪做有机肥翻堆通气。发酵过程注意适当供氧与翻堆(温度升至75℃或以上时要翻倒几次)，升温控制在65℃左右，温度太高对养分有影响。
步骤六、发酵猪粪做有机肥发酵完成。一般20天可发酵完成，物料呈黑褐色，温度开始降至常温，表明发酵完成。如锯末、木屑、稻壳类辅料过多时，应延长发酵时间，待充分腐熟。
如果制造加工商品化有机肥，还需要调节养分和水分达到行业标准。据了解，目前执行的农业标准NY525-2012要求总养分含量（N+P2O5+K2O）≥5%;H2O≤30%.农富康专家表示，如果单纯用猪粪做原料很难达到标准，一般需要额外添加一些原辅料，如木炭灰等。或者在发酵之后添加不同比例的氮、磷、钾拌和。据了解，还可以添加功能菌，继续发酵，制成各种功能性有机肥。
条垛堆肥是比较常见一种方式，把原料堆成条垛，地下埋通气管道进行间歇性鼓风供氧，每天翻堆1次。
沼气池中下层沼渣也可以作为有机肥原料，但缺点是氮挥发损失多，而且含水量高。
对小规模猪场来说，一定面积的储粪池就可以进行堆肥。针对小规模猪场也有小型的发酵设备，但成本比较高，一般不推荐使用。而规模化猪场需要更大的场地和设备制造加工有机肥。
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