一、服务简介
利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。在蛋白质组数据库中储存了有机体、组织或细胞所表达的全部蛋白质信息，通过用鼠标点击双向凝胶电泳图谱上的蛋白质点就可获得。近年来，生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。
二、服务内容
1.基础套餐
（1）鉴定蛋白总体统计分析（共7项，iTRAQ/SILAC实验专有分析）
（2）非模式生物到模式生物的数据ID映射
（3）数据ID号转换
（4）差异蛋白的GO功能注释和分类
（5）差异蛋白KEGG Pathway 代谢通路注释和分析
（6）string蛋白质互作网络分析
（7）表达模式聚类
2.单项分析
（1）数据分析
>匹配转录组学数据（需客户先将基因序列转化为氨基酸序列）与该物种蛋白组学数据
>数据ID号转换（主要数据库：Uniprot、NCBI、KEGG、Ensembl、EBI）
>项目外Mascot检索、ProteinPilot检索
（2）生物信息学分析
>非模式生物到模式生物的数据ID映射
> COG/CDD 注释
>差异蛋白的GO功能注释和分类
>差异蛋白的GO富集分析
>差异蛋白KEGG Pathway代谢通路注释和分析
>差异蛋白的Pathway富集分析
> String蛋白质互作网络分析
>多样品间表达模式聚类
>蛋白基本性质分析
>表达模式K-均值(K-means)聚类分析
> IPA蛋白质互作分析
生物信息学分析的数据库中一般只包含模式生物信息，因此对于非模式生物，需要先将其数据ID映射到非模式生物的数据ID，才能进行后续分析。
常见模式生物包括：
模式动物：人、大鼠、小鼠、线虫、斑马鱼、果蝇；
模式植物：拟南芥；
模式微生物：大肠杆菌、酿酒酵母、裂殖酵母
