当排烟温度达到150℃时保护报警，司炉可以采取减负荷减送风、引风等措施，烟温达到160℃时第2次报警，继续减少负荷等措施达到降低烟温的目的，达到170℃报警的同时开始保护动作喷水。锅炉除尘器监视烟温下降趋势，回落到160℃以下停止喷水，继续监视，直到排烟温度恢复正常。超过180℃应紧急停炉。
锅炉除尘器防止挥发分高的烟煤未燃尽的煤粉在烟道和除尘器死角积存，或锅炉忽然灭火将煤粉抽致炉后造成二次燃烧，当发现除尘器进口温度忽然升高很多，马上紧急停炉，采取停引风机联跳送风机和给粉等措施。
锅炉除尘器在运行中发现某一单元室差压变小导致排放浓度升高，即有破袋，且气流通过滤袋上很小的破洞会导致该滤袋及四周邻近滤袋的很快破坏，造成灾难性的损失。因此，必须检测除尘器，及时更换或封闭破袋。可用喷进荧光粉和用使荧光粉发光的紫外灯来检测定位破袋!。
锅炉除尘器假如滤袋在线更换，必须限制气流直到滤袋已充分调节好!即新袋要预涂粉尘层，尽可能使其阻力与其他滤袋相当，以免导致过滤风速过高而损坏滤袋。低温运行可导致灰层上的酸冷凝，腐蚀滤袋和袋笼，锅炉管道泄漏可导致烟尘带水造成灰层硬化!燃油时操纵不当可导致烟尘带油，造成部分滤袋失效，这是运行中常见的故障，运行操纵中要特别留意。