联机调试是指将PLC安装到控制柜中，并连接输入元件和输出负载，运行控制程序进行整体调试的过程。
在对程序进行模拟调试的同时，可以设计、制作控制柜，PLC之外其他硬件的安装、接线工作也可以同时进行。完成控制柜内部接线后，应测试接线。可以在控制柜的接线端子上模拟PLC外部的开关量输入信号，或操作控制柜面板上的按钮和指令开关，观察对应PLC输入点的状态变化是否正确。用编程器或编程软件将PLC的输出点强制置位或复位，观察对应PLC的负载(如外部的继电器、接触器等)动作是否正常，或对应控制柜接线端子上输出信号的状态变化是否正确。
对于有模拟量输入的系统，可以给变送器提供标准的输入信号，通过调节单元上的电位器或程序中的参数，使模拟量输入信号和转换后的数字量之间的关系满足要求。
在现场安装好控制柜并完成柜内接线测试后，将外部的输入元件和执行机构接入PLC，将PLC置于运行模式，运行控制程序，检查控制系统是否能满足要求。
在调试过程中将暴露出PLC系统可能存在的硬件问题及梯形图设计中的问题，发现问题后在现场加以解决，直到完全符合要求。全部调试完成后，还要经过一段时间的试运行，以检验系统的可靠性。
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